No Ensino Médio do Colégio Salesiano, os estudantes contam com o método e o material didático do Sistema Bernoulli de Ensino, com uma proposta voltada à preparação para o ENEM e os principais vestibulares. A rotina acadêmica integra aprofundamento dos conteúdos, resolução de questões, acompanhamento do desempenho e estratégias de estudo que favorecem uma preparação consistente para os processos seletivos. Ao longo dessa trajetória, o acompanhamento próximo e os princípios da educação salesiana contribuem para que cada estudante desenvolva autonomia, responsabilidade e equilíbrio para suas escolhas acadêmicas e profissionais.